殺菌鍋可以通過將設備內部的空氣進行壓縮，并在進行保溫殺菌時對產品進行反壓殺菌。而這種殺菌方式較為適合對罐裝類的產品進行殺菌。能夠在對罐裝產品進行加熱時，其內部會存在較高的壓力會，所以為了防止罐頭會出現加壓和跳蓋，能夠通過對罐裝兩端施加反壓力來進行防止。
   反壓殺菌是通過使用壓縮空氣在罐裝產品無法保證產品內外壓力相同時會產生凸罐以及跳罐等問題。但是又由于壓縮空氣是一種擁有較差的導熱能力的氣體，所以在使用蒸汽的時候具有一定的壓力。因此，需要對罐裝產品使用加熱進行殺菌，但不能在設備進行加熱時釋放壓縮空氣，壓縮空氣壓著殺菌鍋設備進行保溫時才可以將其釋放入設備內部。
   殺菌鍋的溫度在進行下降時，蒸汽會出現凝結，所以壓縮空氣可以緩慢的降低設備內部所存在的氣壓。因此，在殺菌鍋菌進行殺菌時，可以根據對殺菌鍋進行操作來確定殺菌鍋應該使用的殺菌溫度、殺菌壓力和殺菌時間。