殺菌鍋在進行運行時，需要注意其是否能夠規范有效的進行殺菌，并且還需要對設備所使用的溫度進行調整，保持穩定的壓力，這樣才能夠是的設備可以擁有較為完整的殺菌效果。
   殺菌鍋設備能夠對產品進行快捷干凈有效的殺菌，而且其在操作不當的時候可能會導致殺菌效果出現較大程度的降低。另外，當設備在進行殺菌時需要擁有一個較為穩定的狀態，這樣可以使得鍋體內部的壓力不會產生降低，從而促使氣體產生溢出。這不僅會對影響到殺菌的效果，而且還會導致設備產生損壞。
   當在使用殺菌鍋時，需要進行注意的是，在放置需要殺菌的產品時，產品之間不能排列的較為緊密，這樣會使殺菌的效果會產生較大的降低。而且在殺菌完成后需要切斷設備的電源并對鍋內的熱量進行降溫、對壓力進行降低，這樣既能夠保證設備的安全，又可以有效保護設備。
   殺菌鍋在運行前需要檢查鍋門的密封性是否完好，并保證設備中的各個閥門以及儀表能夠進行正常的工作運行；當對設備進行運行時需要時刻的對蒸汽、熱水等的儀表進行注意，必要的時候應該能夠立即采取相應的措施。