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能夠?qū)⒕酆塑账徭湹牧姿岫ユI切斷的酶,稱為核酸酶。核酸酶屬于水解酶,作用于磷酸二酯鍵的P-O 位置。 [1] 

核酸酶是在核酸分解的*步中,作用于水解核苷酸之間的磷酸二酯鍵的一種核酸。在高等動(dòng)植物中都有作用于磷酸二酯鍵的。 [2] 

不同來(lái)源的核酸酶,其專一性、作用方式都有所不同。有些核酸酶只能作用于RNA,稱為核糖核酸酶(RNase),有些核酸酶只能作用于DNA,稱為脫氧核糖核酸酶(DNase),有些核酸酶專一性較低,既能作用于RNA也能作用于DNA,因此統(tǒng)稱為核酸酶(nuclease)。根據(jù)核酸酶作用的位置不同,又可將核酸酶分為核酸外切酶(exonuclease)和核酸內(nèi)切酶(endonuclease)。 [3] 

分類介紹

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核酸外切酶

有些核酸酶能從DNA或RNA鏈的一端逐個(gè)水解下單核苷酸,所以稱為核酸外切酶。只作用于DNA的核酸外切酶稱為脫氧核糖核酸外切酶,只作用于RNA的核酸外切酶稱為核糖核酸外切酶;也有一些核酸外切酶可以作用于DNA或RNA。核酸外切酶從3′端開始逐個(gè)水解核苷酸,稱為3′→5′外切酶,例如,蛇毒磷酸二酯酶即是一種3′→5′外切酶,水解產(chǎn)物為5′核苷酸;核酸外切酶從5′端開始逐個(gè)水解核苷酸,稱為5′→3′外切酶,例如:牛脾磷酸二酯酶即是一種5′→3′外切酶,水解產(chǎn)物為3′核苷酸。

核酸內(nèi)切酶

核酸內(nèi)切酶催化水解多核苷酸內(nèi)部的磷酸二酯鍵。有些核酸內(nèi)切酶僅水解5′磷酸二酯鍵,把磷酸基團(tuán)留在3′位置上,稱為5′-內(nèi)切酶;而有些僅水解3′-磷酸二酯鍵,把磷酸基團(tuán)留在5′位置上,稱為3′-內(nèi)切酶。還有一些核酸內(nèi)切酶對(duì)磷酸酯鍵一側(cè)的堿基有專一要求,例如胰臟核糖核酸酶(RNaseA)即是一種高度專一性核酸內(nèi)切酶,它作用于由嘧啶核苷酸C‘3處的羥基與下一個(gè)核苷酸C5’處的磷酸形成的3‘,5’-磷酸二脂鍵,產(chǎn)物為以3′嘧啶核苷酸結(jié)尾的低聚核苷酸和以5’核苷酸開頭的低聚核苷酸。

發(fā)展歷史

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20世紀(jì)70年代,在細(xì)菌中陸續(xù)發(fā)現(xiàn)了一類核酸內(nèi)切酶,能專一性地識(shí)別并水解雙鏈DNA上的特異核苷酸順序,稱為限制性核酸內(nèi)切酶(restriction endonuclease,簡(jiǎn)稱限制酶)。當(dāng)外源DNA侵入細(xì)菌后,限制性內(nèi)切酶可將其水解切成片段,從而限制了外源DNA在細(xì)菌細(xì)胞內(nèi)的表達(dá),而細(xì)菌本身的DNA由于在該特異核苷酸順序處被甲基化酶修飾,不被水解,從而得到保護(hù)。

限制性核酸內(nèi)切酶的研究和應(yīng)用發(fā)展很快,已提純的限制性核酸內(nèi)切酶有100多種,許多已成為基因工程研究中*的工具酶。

限制性核酸內(nèi)切酶可被分成三種類型。Ⅰ型和Ⅲ型限制酶水解DNA需要消耗ATP,全酶中的部分亞基有通過在特殊堿基上補(bǔ)加甲基基團(tuán)對(duì)DNA進(jìn)行化學(xué)修飾的活性。

Ⅰ型和Ⅲ型酶具有限制和修飾兩種作用,而特異性弱,切割位點(diǎn)的序列不固定,不已知,不宜用于基因克隆中。

Ⅱ型限制酶水解DNA不需要ATP也不以甲基化或其它方式修飾DNA,能在所識(shí)別的特殊核苷酸順序內(nèi)或附近切割DNA。因此,被廣泛用于DNA分子克隆和序列測(cè)定。

本質(zhì)研究

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關(guān)于網(wǎng)上描述核酸酶的本質(zhì)是RNA,有一定誤區(qū)。

首先,核酸酶的本質(zhì)是蛋白質(zhì)。

1,如圖是核酸酶的

三級(jí)結(jié)構(gòu)示意圖。可以看出核酸酶是由氨基酸合成的。

2,從發(fā)展歷*看:

RNA的催化作用是在1985年Cech等人對(duì)四膜蟲rRNA自我剪接機(jī)制地深入研究時(shí)發(fā)現(xiàn)的[4]  。而基因工程在1980年就成功做成世界上*只轉(zhuǎn)基因動(dòng)物(小鼠) [5]  。也就說(shuō)1980年就已經(jīng)用核酸酶來(lái)切割DNA獲取目的基因了,而RNA類酶(核酶)的催化作用是在1985年才發(fā)現(xiàn)并提出來(lái)的。

請(qǐng)注意區(qū)分核酶(Ribozyme,有生物催化功能的RNA)和核酸酶(RNAse/DNAse,水解核酸的酶)

酶(enzyme)是由活細(xì)胞產(chǎn)生的、對(duì)其底物具有高度特異性和高度催化效能的蛋白質(zhì)或RNA。酶的催化作用有賴于酶分子的一級(jí)結(jié)構(gòu)及空間結(jié)構(gòu)的完整。若酶分子變性或亞基解聚均可導(dǎo)致酶活性喪失。 [1]  酶屬生物大分子,分子質(zhì)量至少在1萬(wàn)以上,大的可達(dá)百萬(wàn)。

酶是一類極為重要的生物催化劑(biocatalyst)。由于酶的作用,生物體內(nèi)的化學(xué)反應(yīng)在極為溫和的條件下也能高效和特異地進(jìn)行。 [1] 

隨著人們對(duì)酶分子的結(jié)構(gòu)與功能、酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)等研究的深入和發(fā)展,逐步形成酶學(xué)(enzymology)這一學(xué)科。 [1] 

酶的化學(xué)本質(zhì)是蛋白質(zhì)(protein)或RNA(Ribonucleic Acid),因此它也具有一級(jí)、二級(jí)、三級(jí),乃至四級(jí)結(jié)構(gòu)。按其分子組成的不同,可分為單純酶和結(jié)合酶。僅含有蛋白質(zhì)的稱為單純酶;結(jié)合酶則由酶蛋白和輔助因子組成。例如,大多數(shù)水解酶單純由蛋白質(zhì)組成;黃素單核苷酸酶則由酶蛋白和輔助因子組成。結(jié)合酶中的酶蛋白為蛋白質(zhì)部分,輔助因子為非蛋白質(zhì)部分,只有兩者結(jié)合成全酶才具有催化活性。 [1] 

研究歷史

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1773年,意大利科學(xué)家斯帕蘭扎尼(L.Spallanzani,1729—1799)設(shè)計(jì)了一個(gè)巧妙的實(shí)驗(yàn):將肉塊放入小巧的金屬籠中,然后讓鷹吞下去。過一段時(shí)間他將小籠取出,發(fā)現(xiàn)肉塊消失了。

1833年,法國(guó)的*(Payen)和帕索茲(Persoz)從麥芽的水解物中用酒精沉淀得到一種可使淀粉水解生成糖的物質(zhì),并將其命名為diastase,也就是現(xiàn)在所謂的*。后來(lái),diastase在法國(guó)成為用來(lái)表示所有酶的名稱。 [2] 

1836年,德國(guó)馬普生物研究所科學(xué)家施旺(T.Schwann,1810—1882)從胃液中提取出了消化蛋白質(zhì)的物質(zhì),解開消化之謎。

1878年,庫(kù)尼(Kunne)把酵母中進(jìn)行酒精發(fā)酵的物質(zhì)稱為“酶”(enzyme),這次來(lái)自希臘文,意即“在酒精中”。

1913年,美國(guó)科學(xué)家米徹利斯(Michaelis)和曼吞(Menten)根據(jù)中間產(chǎn)物學(xué)說(shuō)推導(dǎo)出酶催化基本方程的米式方程。

1926年,美國(guó)科學(xué)家薩姆納(J.B.Sumner,1887—1955)從刀豆種子中提取出脲酶的結(jié)晶,并通過化學(xué)實(shí)驗(yàn)證實(shí)脲酶是一種蛋白質(zhì)。

20世紀(jì)30年代,科學(xué)家們相繼提取出多種酶的蛋白質(zhì)結(jié)晶,并指出酶是一類具有生物催化作用的蛋白質(zhì)。

1982年,美國(guó)科學(xué)家切赫(T.R.Cech,1947—)和奧爾特曼(S.Altman,1939—)發(fā)現(xiàn)少數(shù)RNA也具有生物催化作用,并將其命名為ribozyme。 [3] 

1982年,美國(guó)科學(xué)家T.Cech和他的同事在對(duì)“四膜蟲編碼rRNA前體的DNA序列含有間隔內(nèi)含子序列”的研究中發(fā)現(xiàn),自身剪接內(nèi)含子的RNA具有催化功能。 [1]  為了與酶(enzyme)區(qū)分,Cech將它命名為ribozyme,譯名“核酶”,在非編碼RNA的分類中它也被稱為“催化性小RNA”。 [1]  [4] 

1986年,Schultz和Lerner研制成功抗體酶(abzyme)。

理化性質(zhì)

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組成

按照酶的化學(xué)組成可將酶分為單純酶和結(jié)合酶兩類。單純酶分子中只有氨基酸殘基組成的肽鏈。結(jié)合酶分子中則除了多肽鏈組成的蛋白質(zhì),還有非蛋白成分,如金屬離子、鐵卟啉或含B族維生素的小分子有機(jī)物。結(jié)合酶的蛋白質(zhì)部分稱為酶蛋白(apoenzyme),非蛋白質(zhì)部分統(tǒng)稱為輔助因子 (cofactor),兩者一起組成全酶(holoenzyme);只有全酶才有催化活性,如果兩者分開則酶活力消失。非蛋白質(zhì)部分如鐵卟啉或含B族維生素的化合物若與酶蛋白以共價(jià)鍵相連的稱為輔基(prosthetic group),用透析或超濾等方法不能使它們與酶蛋白分開;反之兩者以非共價(jià)鍵相連的稱為輔酶(coenzyme),可用上述方法把兩者分開。輔助因子有兩大類,一類是金屬離子,且常為輔基,起傳遞電子的作用;另一類是小分子有機(jī)化合物,主要起傳遞氫原子、電子或某些化學(xué)基團(tuán)的作用。

結(jié)合酶中的金屬離子有多方面功能,它們可能是酶活性中心的組成成分;有的可能在穩(wěn)定酶分子的構(gòu)象上起作用;有的可能作為橋梁使酶與底物相連接。輔酶與輔基在催化反應(yīng)中作為氫或某些化學(xué)基團(tuán)的載體,起傳遞氫或化學(xué)基團(tuán)的作用。體內(nèi)酶的種類很多,但酶的輔助因子種類并不多,常見到幾種酶均用某種相同的金屬離子作為輔助因子的例子,同樣的情況亦見于輔酶與輔基,如3-磷酸甘油醛脫氫酶和乳酸脫氫酶均以NAD+作為輔酶。酶催化反應(yīng)的特異性決定于酶蛋白部分,而輔酶與輔基的作用是參與具體的反應(yīng)過程中氫及一些特殊化學(xué)基團(tuán)的運(yùn)載。對(duì)需要輔助因子的酶來(lái)說(shuō),輔助因子也是活性中心的組成部分。

酶蛋白的大部分氨基酸殘基并不與底物接觸。組成酶活性中心的氨基酸殘基的側(cè)鏈存在不同的功能基團(tuán),如-NH2。-COOH、-SH、-OH和咪唑基等,它們來(lái)自酶分子多肽鏈的不同部位。有的基團(tuán)在與底物結(jié)合時(shí)起結(jié)合基團(tuán)(binding group)的作用,有的在催化反應(yīng)中起催化基團(tuán)(catalytic group)的作用。但有的基團(tuán)既在結(jié)合中起作用,又在催化中起作用,所以常將活性部位的功能基團(tuán)統(tǒng)稱為必需基團(tuán)(essential group)。 [4] 

空間結(jié)構(gòu)

它們通過多肽鏈的盤曲折疊,組成一個(gè)在酶分子表面、具有三維空間結(jié)構(gòu)的孔穴或裂隙,以容納進(jìn)入的底物與之結(jié)合并催化底物轉(zhuǎn)變?yōu)楫a(chǎn)物,這個(gè)區(qū)域即稱為酶的活性中心。不過酶的活性中心(active center)只是酶分子中的很小部分。酶催化反應(yīng)的特異性實(shí)際上決定于酶活性中心的結(jié)合基團(tuán)、催化基團(tuán)及其空間結(jié)構(gòu)。

而酶活性中心以外的功能集團(tuán)則在形成并維持酶的空間構(gòu)象上也是必需的,故稱為活性中心以外的必需基團(tuán)

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