一、 潔凈實驗室位置和環境的選擇
在實驗室規劃時需要注意的是潔凈實驗室在位置選擇方面要遵從潔凈等級的設計要求，應選擇大氣含塵濃度較低，自然環境較好的區域和地段，要遠離落葉和空氣異味的場所，（如河邊、食堂周圍、動力區域等），還要盡量避開振動或噪聲干擾的區域。
選擇實驗室周圍的位置、地形、環境時，要與精密設備、精密儀器、儀表等允許環境振動值進行分析權衡。
二、潔凈實驗室墻體圍護的標準
潔凈實驗室的污染源一般主要是大氣中含塵、含菌、塵粒和微生物以及實驗人員的發塵、實驗設備和實驗操作過程中的產塵等。因此建筑圍護結構質量和建筑施工方法對保持和提高潔凈實驗室的標準具有重要意義。
潔凈實驗室的外圍護結構如門窗、墻板、吊頂板、高效過濾器、電器燈具等方面要充分考慮其保溫、隔熱、防火、防潮、密閉性能好的要求，做到不產塵、無裂痕、可擦洗、耐潮濕，板縫平齊密封，壓縫條平直縫隙小。地面則力求做到耐磨、耐沖擊、耐火、耐侵蝕性好，不易產生靜電，表面不易附著塵粒。
三、 潔凈實驗室的整體布局設計
潔凈實驗室的平面和空間設計，應將潔凈實驗區和人員凈化、設備材料凈化和其他輔助用房進行分區布置。同時應考慮實驗操作、工藝設備安裝和維修、管線布置以及凈化空氣調節系統等各種技術設施的綜合協調效果。
實驗室內各種固定技術設施（如送風口、照明器、回風口、各種管線等）的布置，宜首先考慮凈化空氣調節系統的要求。
潔凈室空氣潔凈度等級的檢驗，驗收時應以動態條件下測試的塵粒數為依據。對于空氣潔凈度為5級的潔凈室內大于等于5微米塵粒的計算應進行多次采樣。當其多次出現時，方可認為該測試數值是可靠的。
確定潔凈實驗室空氣潔凈度等級時，首先要滿足實驗內容和實驗儀器設施對空氣潔凈度的要求，然后還要根據實驗操作步驟和實驗程序布局綜合考慮各個實驗區域的不同凈化等級要求，從而做到既滿足凈化要求又節約成本支出。
四、潔凈實驗室的空氣凈化調節系統
一般情況下，5級、6級潔凈區控制溫度為20℃～24℃，相對濕度為45%～65%;7級、大于7級潔凈區控制溫度為18℃～28℃，相對濕度為50%～65%。對潔凈室溫、濕度無特殊要求時，溫度應控制在18℃～26℃，相對濕度控制在45%～65%。
此外，空氣氣流速度、送風量和新風量要符合凈化室實驗設施和人員的要求。因為凈化實驗室是一個相對獨立密閉的空間，在保持溫度、濕度、空氣流速流量的同時，還要采取措施補償室內排風和保持室內正壓（或負壓）值所需的新鮮空氣量。